Modélisation par homologie des protéines Cry spécifiques aux diptères issues du Bt
Reseña del libro "Modélisation par homologie des protéines Cry spécifiques aux diptères issues du Bt"
Une caractérisation physico-chimique de 4 protéines Cry a été réalisée, permettant d'interpréter des propriétés telles que la masse moléculaire, le pI, l'EC, l'AI, le GRAVY, la composition en acides aminés et l'indice d'instabilité. Les valeurs GRAVY et AI les plus élevées ont été observées pour Cry4Aa (0,827) et cry2Aa1 (84,53). La prédiction des motifs, des structures, des ponts disulfure, de la structure secondaire, des régions transmembranaires et des domaines des protéines Cry a été réalisée à des fins de caractérisation fonctionnelle. Quatre séquences modèles (1I5P, ADL6, 2C9K et 1W99) ont été utilisées pour la modélisation par homologie (SwissModel et EsyPred3D) afin de prédire la structure en 3D. Le score LG des séquences modèles 1I5P, ADL6, 2C9K et 1W99, tel qu'indiqué par SwissModel et EsyPred, indiquait un modèle d'excellente qualité. Les sites actifs de la protéine ont été déterminés par le serveur CASTp et se situaient entre 83 et 239. La surface et le volume de la poche variaient respectivement entre 422,9 et 5 828, et entre 518,1 et 3 719,2. La validation des modèles structuraux a été réalisée à l'aide de PROCHECK. Les modèles ont ensuite été vérifiés à l'aide de WHAT IF. Les deux structures ont été analysées à l'aide de l'outil ProFunc, qui a montré qu'elles avaient des fonctions différentes en raison de leurs structures et sites actifs distincts. La structure joue donc un rôle essentiel dans la détermination de la fonction de la protéine.